在plob论坛学习到不少知识,其中看到很多关于bioperl的文章,但是没有见到人们用biopython的。 所以在此分享一个简单代码,用来翻译核酸为蛋白序列。 注:需要Biopython库支持。 以...
分子生物中心法则
DNA是遗传物质,是携带遗传信息的载体。信息从基因的核苷酸序列中被提取出,用来指导蛋白质合成的过程对地球上的所有生物都是相同的,分子生物学家称之为中心法则(central dogma)。生物体的遗传信...
利用BioJava将DNA序列转录成RNA序列
在Biojava中,DNA和RNA序列以及标志链(SymbolList)使用不同的字母表。你可以使用RNATools的静态方法transcribe()将DNA转录成RNA。 [code lang="j...
利用BioJava翻译DNA序列或标志链
要将DNA翻译成蛋白必须执行下列步骤: 转录成RNA 获得标志链的密码子(三联子) 翻译成蛋白 大部分可以通过使用Biojava的Tools类的静态方法实现。下面的程序展示了这个过程。当然了,如果你的...
利用BioJava将单个密码子翻译成氨基酸
通常的翻译的例子展示了如何使用RNATools将RNA标志链翻译成蛋白质,但是具体细节隐藏在translate()方法中。如果你想将单个的密码子翻译成氨基酸,那么你就要明白具体的细节了。 实际上有很多...