string数据库是PPI领域里面最完备已经最受欢迎的数据库了。如果直接在谷歌里面搜索PPI，映入眼帘就是string的官网，它们的主页现在是html5啦，比较精美： http://string-db...

一、蛋白质的结构与功能预测 蛋白质结构与功能的研究已有相当长的历史，由于其复杂性，对其结构与功能的预测不论是方法论还是基础理论方面均较复杂。统计学方法曾被成功地应用于蛋白质二级结构预测中，如Chou和...

一直以来学生们被教授蛋白质的三维形状对于它的功能是至关重要的，但原来许多的蛋白质是以“混乱”的状态存在且具有功能。 如果你打开任何一本生物学教材翻到蛋白质的部分，你将会学到蛋白质是由氨基酸序列组成，序...

1.三维分子类 RASMOL：观看生物分子3D微观立体结构 RasTop：为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件 CHIME：直接在浏览器中观看3D分子 MolMol：将pdb等格式的蛋白文件通...

随着蛋白质数量的增加，对于这些蛋白质的分类与注释成为一个非常活跃的课题。这里将包含所有蛋白质序列的集合称为nr库，在nr库中，序列与序列的相似性是不均等的，当我们使用blast进行序列两两比对的时候，...

在Biojava中，DNA和RNA序列以及标志链(SymbolList)使用不同的字母表。你可以使用RNATools的静态方法transcribe()将DNA转录成RNA。 [code lang="j...