Script使用R按照指定宽度计算覆盖率 如何使用R来按照bin(比如说每200碱基宽)来计数覆盖度并生成一个bedgraph文件呢? 这个其实就是所谓的resample问题。可以使用?tileGenome来解决。 [code lang="R... 03月26日4,789评论 阅读全文
Glossary深度(depth)与覆盖度(coverage) 假想实验 对长100bp的目标区域进行捕获测序:采用单端测序,每个read长5bp;总共得到了200个reads;把所有的reads比对到目标区域后,100bp的目标区域中有98bp的位置至少有1个r... 12月18日16,573评论 阅读全文