转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合,转录组测序(RNA-seq) 是最近发展起来的利用深度测序技术进行转录分析的方法,可以对全转录组进行系统的研究。 Roche GS FLX Ti...
Velvet and Oases For Transcriptome Assembly(基于转录组进行拼接)
首先要有Linux环境的服务器或PC,推荐最低需求: 64bit Linux System (Rethat, CentOS, Fedora), 4 core CPU processors, 2.26G...
GenePattern:一个强大的基因组学分析平台
GenePattern是一个强大的基因组学分析平台,该平台整合了大量的基因表达分析、蛋白质组学分析、SNP分析、流式细胞分析、RNA-seq数据分析以及一些常规的生物信息学分析工具。 以下是官方介绍:...
RNA-SeQC:RNA-Seq数据质量控制的计量方法
RNA-SeQC是一个计算一系列对RNA-Seq数据进行质量控制的计量学的java程序。输入内容可以是一个或者多个BAM文件。输出文件是则包括计量数据的HTML报告和tab delimited文件。这...
转录组测序(RNA-seq)技术
转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水 平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾...