之前介绍了用RAxML构建极大似然进化树的方法。本文另外介绍一款很经典的构建进化树的软件--- Phylip。 以下是官方介绍： PHYLIP is a free package of program...

张金龙 中国科学院植物研究所，jinlongzhang01@gmail.com   RAxML 是用极大似然法建立进化树的软件之一，可以处理超大规模的序列数据，包括 上千至上万个物种，几百至...

方法的选择 首先是方法的选择。 基于距离的方法有UPGMA、ME（Minimum Evolution，最小进化法）和NJ（Neighbor-Joining，邻接法）等。其他的几种方法包括MP（Maxi...

BioEdit是一个功能很强大的生物学软件，整合了很多常用的生物信息工具。如：多序列比对，质粒图谱的绘制，查看DNA序列的酶切位点等等。 使用BioEdit可以方便的生成和绘制进化树。 首先，打开序列...