1. 重复序列简介和相关软件 参考自文献:Review:Identifying repeats and transposable elements in sequenced genomes: how ...
利用MISA鉴定简单重复序列(SSR)
在基因组中存在着大量的重复序列,根据其重复的程度可分为简单重复序列、中度重复序列和高度重复序列。简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)在真核生物基因组中广泛存在,一般是以...
De Bruijn Graphs for Alternative Splicing and Repetitive Regions
Today we shall examine de Bruijn graphs for two structures that occur frequently in genomes or trans...
高度重复序列简介
高度重复序列在基因组中重复频率高,可达百万(106)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。 (1)倒位(反...