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dCAS:Desktop cDNA Annotation System
The Desktop cDNA Annotation System (dCAS) automates large-scale cDNA sequence analysis. dCAS allows ...
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测一个未知基因组(de nove sequence),要进行测序、拼接及注释。关于测序仪和拼接软件已经讲的很多了,很少有关于基因组注释的文章。一篇最近在Nature Review Genetics上的...
蛋白注释相关的工具
随着蛋白质数量的增加,对于这些蛋白质的分类与注释成为一个非常活跃的课题。这里将包含所有蛋白质序列的集合称为nr库,在nr库中,序列与序列的相似性是不均等的,当我们使用blast进行序列两两比对的时候,...
CAMBer与CAMBerVis:比较分析多个细菌及其结构注释的可视化
CAMBer(Comparative Analysis of Multiple Bacterial Strains)是一款比较分析多个细菌基因组的软件,同时CAMBerVis这款软件可以同时对多个细菌...
RNAseq中Reads的可视化及注释
对于复杂的组学数据,能尽可能方便地直接观察数据对于数据的分析和解释都非常重要,对新一代测序数据的可视化和交互展示是一个非常重要但容易被人忽视的问题.不深入考查数据的细节,而是满足于对数据的统计分析,是...