Bioinformatics利用samtools mpileup和bcftools进行SNP calling 运行samtools faidx和pileups 前期请先阅读《序列比对工具的对比》 # 我们现在有bwa.bam和bow.bam两个文件。 # Pileup的输出。wgsim模拟器生成的低质量rea... 02月25日14,960评论 阅读全文
Genomicsbcftools使用笔记 什么是vcf?全称是variant call format,是用来记录SNP,INDEL和SV变异信息的文本。在GATK软件中得到最好的支持,当然SAMtools得到的结果也是VCF格式,和GATK的... 03月03日3,298评论 阅读全文