当我们进入大数据时代之后,并行运算就十分重要了。什么是大数据呢?引用一句流行语吧: Big data is hype. Everybody talks about big data; nobody k...
通过bioconductor包来获取所有的芯片探针与gene的对应关系
现有的基因芯片种类不要太多了! 但是重要而且常用的芯片并不多! 一般分析芯片数据都需要把探针的ID切换成基因的ID,我一般喜欢用基因的entrez ID。一般有三种方法可以得到芯片探针与gene的对应...
推荐一个R & Bioconductor的使用手册网站
这个网站上包含了Bioconductor各种分析的R脚本和方法,包括:KEGG,pathway分析。如下所示: 网站链接:http://manuals.bioinformatics.ucr.edu/h...
差异表达基因的分析(2)
应学生及个别博友的要求,尽管专业博文点击率和反应均很差,但在去San Diego参加PAG会议之前,还是抽时间给出【R高级教程】的第二专题。专题一给出了聚类分析的示例,本专题主要谈在表达谱芯片分析中如...