Statistics

SPSS:利用Bootstrap法轻松计算可信区间

临床研究的论文中越来越多的统计描述会涉及可信区间的展示。今时今日,仅仅告诉审稿人两组的分布和假设检验的p值是不够的。这对我们的统计分析提出了新的要求,也就是除了基本的描述外,还需要报告可信区间。可是在...
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Evolution

进化树上Bootstrap和Identity区别

Bootstrap,即自展值,是用来检验你所计算的进化树分支可信度的。简单地讲就是把序列的位点都重排,重排后的序列再用相同的办法构树,如果原来树的分枝在重排后构的树中也出现了,就给这个分枝打上一分,如...
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Evolution

对于bootstrap的一些粗浅认识

什么是bootstrap? bootstrap就是从一个原始样本中进行有放回的重复采样,采样大小和原始样本大小相同,采样次数根据计算量而定。从每个重新样的样本中可以计算某个统计量的bootstrap ...
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Evolution

用RAxML构建极大似然进化树

张金龙 中国科学院植物研究所,jinlongzhang01@gmail.com   RAxML 是用极大似然法建立进化树的软件之一,可以处理超大规模的序列数据,包括 上千至上万个物种,几百至...
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Glossary

什么是bootstrap

Bootstrap又称自展法,是用小样本估计总体值的一种非参数方法,在进化和生态学研究中应用十分广泛。例如进化树分化节点的自展支持率等。 Bootstrap的思想,是生成一系列bootstrap伪样本...
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