前言 我们知道,细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用,另一个通过细胞产生的可溶性小分子,即细胞因子。在单细胞数据分析中下游,有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互作用,就有人推荐我们做一个...
单细胞分析之CellChat
CellChat简介 CellChat的特点 全面的数据:大多数的细胞通讯分析方法通常只考虑配体/受体基因对,往往忽略了多亚基复合物受体和其他信号辅助因子。CellChat的作者人工挑选了2021个经...
细胞互作:单细胞配受体库
Cell-Cell Interaction Database 描述了通过过滤已有的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)数据,细胞-细胞相互作用数据库的自动构建。细胞间的相互作用对理解组织结构很重要。我们和...
从基因表达解读细胞之间的相互作用和交流
目前单细胞转录组技术的快速发展,关于单细胞转录组数据的应用也越来越宽泛,其中细胞相互作用的探索尤为重要。 细胞互作存在多种形式 自分泌信号转导是指细胞内通讯,细胞分泌配体,这些配体用于通过同源受体诱导...
CellChat细胞通讯分析
写在前面的话:关于细胞通讯的工具有很多,cellchat只是其中一个。网上关于CellChat的解读也很多,我在学习的时候也参考了一些,具体参考列表我都在文中标注了哈。这里只是我在学习细胞通讯和Cel...
生物组织内细胞通讯
在多细胞生物组织内,细胞往往通过介质将发送的信息传递给其他细胞。信息一旦发出,其他细胞会做出三种反应:响应、无响应和接收不到。这种模式非常类似于我们用电话跟其他人打电话时的场景,当我们拨打电话之后,对...