染色质免疫共沉淀测序(ChIP-Seq)是指对染色质免疫共沉淀(ChIP)获得的DNA片段进行大规模测序,并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。 Roche GS FLX Titaniu...
ChIP-Seq测序深度如何选择?
ChIP-seq分析过程中,随着测序深度加大,读长数目增多,分析得到的结合位点(‘峰’)的数目也随之增多,但会出现饱和,饱和以后,读长数目增加, ‘峰’的数目基本上不再改变。根据这个规律,为了确定测序...
ChIP技术
原理: 真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此,研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecip...