富集分析是了解一个基因集功能倾向性的一个方式,在组学研究领域应用广泛。常见的有基于差异基因的Over-representation分析,也就是常说的GO、KEGG富集分析和Functional cla...
Cytoscape作图介绍
Cytoscape 的核心是网络,简单的网络图包括节点(node)和边(edge),每个节点可以是基因、miNRA或OTU等等;节点与节点之间的连接 (edge) 代表着这些节点之间的相互作用,包括蛋...
如何用Cytoscape提升文章档次
做完microRNA芯片测序之后预测microRNA的靶基因,筛选重要的靶基因进行验证是研究中的常见套路,做出结果后写到文章Result里大致如下。 如果我是审稿人,看到这么干巴巴的一段话肯定心情烦躁...
Cytoscape基础教程笔记
昨天开始学用Cytoscape,其tutorial分为两个部分,基础的和高级 的。基础教程又分成了四课:Getting Started、Filters & Editor、Fetching Ex...