简介 Phred是 phred\phrap 软件包的一部分,phred\phrap 软件包由华盛顿大学分子生物技术学院的 Phil Green 和 Brent Ewing 开发,主要用于学术科研活动。...
DNA第7种和第8种碱基
据美国每日科学网站7月22日(北京时间)报道,美国科学家在7月21日出版的《科学》杂志上撰文指出,他们找到了DNA的第7种、第8种碱基,并在人体胚胎干细胞和实验老鼠器官染色体组的DNA中发现了这两个碱...
基因组测序永无止境的根本原因
1869年瑞士青年学者米歇尔(Johann F. Miescher,1844—1895年)在莱茵河鳟鱼的精子里发现了脱氧核糖核酸分子,即现在大家熟知的DNA。他虽然也曾猜想过DNA可能与遗传有关,但还...
遗传信息载体—DNA
生物可以繁殖,能够复制出新的一代,通过繁殖后代使物种得以遗传和延续。生物的复制由基因所决定,复制是生命的基本特征,但不是生命的全部特征。计算机程序可以自动复制大量的拷贝,但是这些程序不是活动的生命,活...
基因与两性
作者:三思逍遥 自1953年,DNA奠定了其遗传物质的地位以后,几乎所有生物的机体塑造,主要由其所携带的DNA——更具体的说法是由其所拥有的基因——所决定就已成为共识。但我们对生命世界的兴趣,并不仅局...
新的DNA“语法”规则诞生
60年来,生物学家一直只了解两条规范“DNA语言”的类似语法的规则。现在他们又发现四条 奥地利生物化学家埃尔文·查戈夫(Erwin Chargaff)因于1950年发现了两条“DNA语言”语法规则而著...
DNA各种序列格式介绍
1.Plain格式 A sequence in plain format may contain only IUPAC characters and spaces (no numbers!). Not...
利用BioJava将DNA序列转录成RNA序列
在Biojava中,DNA和RNA序列以及标志链(SymbolList)使用不同的字母表。你可以使用RNATools的静态方法transcribe()将DNA转录成RNA。 [code lang="j...
BioJava中如何使用非标准的密码子表
在一般的翻译例子中我们使用RNATools中的方法translate()就能够很容易的进行翻译。这对于使用一般的通用翻译表来说非常合适。但有的时候,你可能使用一些诸如叶绿体翻译表等偏僻的翻译表。幸运的...
测序峰图的基本知识
测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件,峰图文件为Abi格式,用chromas软件(网上可下载)打开. 四种颜色的波形代表四种碱基的信号强度; 正常的峰图,波峰与波谷清晰...