对于RNA-seq,除了gene水平的差异分析外,还可以进行exon水平的差异分析。这时可以使用Bioconductor的DEXSeq软件包。 使用DEXSeq软件包,其输入为Count table。...
外显子组测序
外显子(exon)是真核生物基因的一部分,包含着合成蛋白质所需要的信息。全部外显子,称为“外显子组”(Exome)。外显子组测序(Exome sequencing)是指利用序列捕获技术将全基因组外显子...
可变剪接与蛋白质组多样性及其调节机制
武春晓 前言 可变剪接是指从一个mRNA前体中通过不同的剪接方式(选择不同的剪接位点组合)产生不同的mRNA剪接异构体的过程。可变剪接是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制。剪接过程受多种顺式作...
外显子组测序很给力,但并不完美 Exome sequencing is not perfect
相关链接: http://www.ebiotrade.com/newsf/read.asp?page=2012523101924488 在《科学美国人》的博客上,遗传学者Ricki Lewis谈道,尽...