需要用安装好的sratoolkit把sra文件转换为fastq格式的测序文件,并且用fastqc软件测试测序文件的质量! 数据解压 之前下载了所有的数据,但只有样本915才是mRNA-Seq测序结果,...
FASTQ格式解释和质量评估
FASTQ文件格式和命名 高通量测序之后用于下游分析的数据一般存储在FASTQ文件中。为了节省空间,又不影响下游使用,也一般用gzip压缩的格式。 单端测序每个文库只返回一个FASTQ文件,双端测序两...
用FastQC检查二代测序原始数据的质量
当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projec...