群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种,最常用的就是Fst指数。Fst指数,由F统计量演变而来。F统计量(FIS,FIF,FST)主要有三种。Fst是针对一对等位基因,如果基因座上存在复等位基因...
群体分化指数-Fst
简单介绍F-statistics 和 Fst 1. 概念 在群体遗传学中,F-statistics(Fixation indices)是衡量种群中基因型实际频率是否偏离遗传平衡(哈温平衡)理论比例的指...
群体固定系数Fst
Fst,用于衡量种群分化程度,取值从0到1,为0则认为两个种群间是随机交配的,基因型完全相似;为1则表示是完全隔离的,完全不相似。它往往从基因的多样性来估计,比如SNP或者microsatellite...
群体遗传分化
1. 群体遗传分化的度量 (1)F-统计量 现实植物自然群体并非是理想群体,如果仅考虑单基因座上一对等位基因,对于由若干个地方群体组成的生物大群体,各层次现实群体中基因型频率期望值偏差一般用Fis、F...
让基因筛选变得更简单:群体进化选择消除分析
游戏“天天爱消除”曾经风靡一时,想必大家一定都玩过。其实在重测序分析中也有一个分析“爱消除”,那就是选择消除分析。群体进化选择消除分析:简单的说就是基因组某区域由于受到了选择而消除多态性。选择消除分析...