一：下载安装该R包 clusterProfiler是业界很出名的YGC写的R包，非常通俗易懂，也很好用，可以直接根据cuffdiff等找差异的软件找出的差异基因entrez ID号直接做好富集的所有内...

一，所谓的网站，其实就是一个网页版的可视化软件接口而已 看看网站主页，看看它需要什么数据 http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl 二，所需要...

这一篇文章中主要是使用David进行GO分析的数据处理流程和简单的代码，具体GO分析的原理就不再涉及。 导出基因列表 #基因列表的导出 gene_cluster <- rownames(as.m...

首先要明白，需要下载什么？ 要下载四万多条GO记录的详细信息（http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo） 要下载GO与GO之间的关系（http://...

本教程使用GOstats来对给定的基因symbols做富集分析。 [code lang="R"] > library("org.Hs.eg.db") > library...

1.GO怎么就出现了？ 现今的生物学家们浪费了太多的时间和精力在搜寻生物信息上。这种情况归结为生物学上定义混乱的原因：不光是精确的计算机难以搜寻到这些随时间和人为多重因 素而随机改变的定义，即使是完全...

miRNA研究现在是如火中天了，不少同学现在也开始从事这方面研究。有些同学常常会迷惑，因为不知道到底需要做哪些研究。下面简单和大家分享一下miRNA测序后分析的主要内容有哪些。 一、基因注释（推荐） ...

第一步：利用BLAST作比对 下载NCBI的nr数据库 NCBI的nr数据库一般可以从ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/ 下载，里面nr库有两种格式，一种是原始的nr蛋白...

GO委员会工具 AmiGO [http://amigo.geneontology.org/cgi-bin/amigo/go.cgi] AmiGO提供检索和浏览GO委员会提供的本体学(ontology)...