本文将以MACS为例,介绍ChIP-seq数据的处理流程。为节省篇幅,本文略去测序数据预处理、mapping reads等步骤,直接从peak-calling开始讲起。 一、首先粗略地介绍一下MACS...
MACS(Model-based Analysis of ChIP-Seq)使用说明
在使用Bowtie比对于完Chip-Seq的结果后,就需要用到MACS或者ERANGE来找出峰所在的位置了。但是由于ERANGE的设置比较复杂,所以最为流行的还是MACS。 我们首先来了解一下MACS...