如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候,大家得到的序列都是单个基因的长度,所以一般都是逐个基因的比较,用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方式搜索数据库。但是1999...
Average Nucleotide Identity (ANI) 计算
ANI概念 Average Nucleotide Identity (ANI) 是在核酸水平,两两基因组之间所有直系同源蛋白编码基因的相似性,常用于研究基因组之间的进化距离。相较于传统的 DNA-DN...
MUMmer使用介绍
MUMmer是一个快速比对两个基因组序列的软件。在一个普通的linux机器上,比对两个3~4Mb的基因组所需要的时间只要30秒不到。其余还有很多功能将在下面详细说明。 MUMmer的主页为http:/...