物种的信息集合都在它的NCBI的taxid号里面，在NCBI里面关于它的英文介绍地址如下 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/taxonomy/ ，NCBI人为的给自然...
SRA、SAM以及Fastq文件高速下载方法
NCBI-SRA和EBI-ENA数据库 SRA数据库: Sequence Read Archive：隶属NCBI (National Center for Biotechnology I...
GEO数据上传操作指南
科研工作者在发表paper的时候，如果文章中涉及高通量测序数据分析，就需要提前向NCBI上传数据获得登录号。然而，如何向NCBI提交这些序列？今天就来介绍一种重要的NCBI数据库GEO，它可用于存储测...
NCBI SRA数据库使用详解
做为一个合格的生物信息菜鸟，没钱测序咋整，免不了到处求数据呀找数据.....练好基本功必须先从找数据开始！今天小编就来介绍一下一个存储大量高通量数据的的数据库-SRA。 1、简介 SRA（Sequen...
NCBI的基因entrez ID相关文件介绍
地址：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/gene/DATA/ 里面主要有以下几个文件 我这里主要介绍gene2ensembl，gene2accession， gene2pubmed...
上传基因组数据到NCBI
1、创建 BioProject 号和 BioSample 号 对某一个物种进行了基因组测序，则申请 BioProject 和 BioSample 号各一个。 2、使用 tbl2asn 准备后缀为 .s...
手把手教会高速下载SRA数据
一、SRA数据结构 SRA（Sequence Read Archive）数据包括下面四级。 NCBI BioProject：PRJN**** ，是单个研究计划，可能包含多个样本和数据集。 SRA Ex...
linux下用Aspera从NCBI上下载SRA格式宏基因组数据
1、首先安装Aspera 参考《使用Aspera从EBI或NCBI下载基因组数据》，保证该软件在服务器上已经可用。 测试代码，注意最后有个点，代表下载到当前目录下： ascp -i /your-p...
COBALT:NCBI在线蛋白多序列比对
COBALT is a multiple sequence alignment tool that finds a collection of pairwise constraints derived...
如何向NCBI提交序列(在线提交法)
这里将要介绍的是如何向NCBI数据库直接提交你的DNA或RNA序列，结合本人的实际设计操作经验来给大家一个简单便捷的方法。因为我本人也是最近摸索出来的经验总结，希望对打算提交序列的同学有所指导帮助。 ...