PET概述 将由各种前期实验得到较长的DNA片段,取出其前后两个端的小段序列,称作Paired-End Tags, 将这些tags进行测序然后map到基因组上,从这两个tags就可以知道得到了基因组上...
不同长度mate-pair在组装上之差异
有时候会遇到使用者询问,为什么做不同长度的mate-pair呢? 这是因为contig间的距离不同,为了将这些不同距离的contig 组装起来,得到更完整的组装信息,所以才需要使用不同长度的mate-...
Velvet使用方法及参数介绍
Velvet简单介绍: velvet是一款常用的基因组拼接软件,与soapdenovo一起常用于二代测序数据的处理,相对于soapdenovo拼接的完整性更好。他能同时支持fasta、fastq格式的...