PAML软件中的codeml命令可以使用Maxmum Likelihood方法对密码子或氨基酸的多序列比对结果进行分析和进化参数计算 。这两种数据共用一个命令,程序运行时的参数绝大部分是公用的,但仍需...
PAML中文手册
1 综述 PAML(将最大似然法用于系统发育分析)是一个用最大似然法来对DNA和蛋白质序列进行系统发育分析的软件包。 PAML 文档 除了这个手册,请注意以下资源: PAML站点:http://aba...
PAML使用 – codeml的配置文件
seqfile = seqfile.phy * sequence data filename treefile = tree.tre * tree structure file name outfil...