在画heatmap的时候,往往由于某种数据分析需要,需要获得聚类后的heatmap的col和row的顺序。这里展示如何从pheatmap的聚类结果中提取我们需要的信息。 这里通过产生随机数据来演示。 ...
从pheatmap无缝迁移至ComplexHeatmap
pheatmap是一个非常受欢迎的绘制热图的R包。ComplexHeatmap包即是受之启发而来。你可以发现Heatmap()函数中很多参数都与pheatmap()相同。在pheatmap的时代(请允...
R绘图基础(10)热图 heatmap
我们在分析了差异表达数据之后,经常要生成一种直观图--热图(heatmap)。这一节就以基因芯片数据为例,示例生成高品质的热图。 比如 钢蓝渐白配色的热图 首先还是从最简单的heatmap开始。 &g...