ggplot2包是基于Wilkinson在《Grammar of Graphics》一书中所提出的图形语法的具体实现, 这套图形语法把绘图过程归纳为data, transformation, scal...
如何使用conda安装R和R包
生物信息分析常遇到R和R包使用和安装问题，最新版的R包特别难安装，而conda可以很好的解决这个问题。conda的安装相对简单此处不再赘述。 1. R安装 使用conda安装R时，最好先使用conda...
R语言绘图速查手册(58图)
图目录： 基本散点图;200 个正态分布的随机数 point 散点图;200 个正态分布的随机数 geom_point 散点图;200 个正态分布的随机数 基本折线图;10 个正态分布的随机数 lin...
R语言的重复行名处理
R语言在处理和分析数据上有其独有的优势，但也有一些让人一言难尽的智障操作，比如下面想讲的R语言中表格（矩阵）行名重复的处理。事情的起因是这样的，我最近在帮另一个研究组处理一些RNA-seq的数据，他们...
二十大数据可视化工具点评
如今学习应用数据可视化的渠道有很多，你可以跟踪一些专家博客，但更重要的一点是实践/实操，你必须对目前可用的数据可视化工具有个大致了解。以下是Netmagzine列举的二十大数据可视化工具...
R 绘图参数设置函数par()详解
转自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_9f23a8da01019bjv.html par()函数是R里有关绘图的重要函数之一，以下是对par()函数说明内容的一些整理。 ...
利用ggplot2画出各种漂亮图片详细教程
《使用ggplot2画图》 作者：Guangchuang Yu 原文链接：http://ygc.name/2014/05/11/use-ggplot2/ 1、Why use ggplot2 ggplo...
数据可视化完美指南-R-python
从数据到图表 有什么样的数据做什么样的图 作者提供了一张树状图，帮助并引导我们找到合适自己数据的的可视化方式 What kind of data do you have? Pick the main ...
使用R按照指定宽度计算覆盖率
如何使用R来按照bin（比如说每200碱基宽）来计数覆盖度并生成一个bedgraph文件呢？ 这个其实就是所谓的resample问题。可以使用?tileGenome来解决。 [code lang="R...
Bioconductor并行(parallel)运算
当我们进入大数据时代之后，并行运算就十分重要了。什么是大数据呢？引用一句流行语吧： Big data is hype. Everybody talks about big data; nobody k...