A. 主成分分析 主成分分析(principal components analysis, PCA)是一种分析、简化数据集的技术。它把原始数据变换到一个新的坐标系统中,使得任何数据投影的第一大方差在第...
用R画直方图
平时在做数据分析的时候很多图都是用excel画,包括直方图。今天给大家分享两段用R画直方图的代码。 代码一: [code lang="R"] data=c(4.51,10.69,9.33,7.34,5...
用R画箱线图(boxplot)
前面的一篇文章给大家介绍了箱线图的含义,《 箱线图(boxplot)介绍 》。现在给大家分享用R画画箱线图的代码。 代码如下: [code lang="R"] finaldata<-data.f...
用R绘画3D饼图
通过使用plotrix包的pie3D命令,可以在R中绘制3D饼图。 [code lang="R"] #载入包 library("plotrix") #数据 pieval <-...
利用R在一幅图中绘制多个子图
在R中,如何实现在一幅图中绘制多个子图呢,特别是当子图是以群组(group)来归类的时候?下面提供两种解决方案: 先虚构一组数据: [plain] Group Class Num A X 80 A Y...
定制R启动环境
本文翻译自R in Action的附录B,如果对该书感兴趣,请自行购买或去图书馆阅读。 R导论的10.8也是讲定制环境的。 程序员最喜欢做的事之一是定制启动环境,好让程序按照他们喜欢方式工作。定制启动...
Linux安装R语言包
1. R包介绍 R的包(package)通常有两种: 二进制代码包(Binary package):这种包属于即得即用型(ready-to-use),但是依赖与平台,比如Windows和Linux平台...
生物信息画图颜色搭配以及颜色卡
最近在用Qt写一个可视化软件,需要预先设定一些颜色搭配。刚好在网上收到了两张不错的颜色搭配图,与大家分享一下。大家在用R、matlab等画图的时候可以参考一下。 颜色搭配图: 各种颜色对应的名称与RB...
主成份分析(PCA)在生物芯片样本筛选中的应用及在R语言中的实现
主成份分析方法可以对基因芯片的样本聚类情况进行可视化,可获得样本在实验组和对照组之间的直观分布情况,从而便于对异常样本进行检测和去除,否则异常样本的存在将会对差异基因的鉴定等后续分析造成不利影响。下面...
多重检验中的FDR错误控制方法与p-value的校正
数据分析中常碰见多重检验问题(multiple testing).Benjamini于1995年提出一种方法,通过控制FDR(False Discovery Rate)来决定P值的域值. 假设你挑选了...