ENCODE项目向我们揭示,人类基因组中超过70%能得到转录,只不过不会发生在同一个细胞里。为了研究如此多样的转录本,研究人员开发了许多技术,其中RNA测序(RNA-seq)是最全面也最有效的。 许多...
RNA测序研究现状与发展
通常来说,某一个物种体内所有细胞里含有的DNA都应该是一模一样的,只是因为每一种细胞里所表达的RNA之间存在差异,才使这些细胞有所区别。诸如“为什么肿瘤细胞与正常细胞会不一样?”这样的重要问题都可以通...
最新研究质疑RNA测序数据的统计分析
过去几年间,高通量RNA测序已经取得了一些意想不到的成果,其中一些似乎是能够改写传统遗传学智慧的突破性发现。但是,这些调查结果现在受到了挑战,计算生物学家警告说,在这些数据密集型研究(data-int...
非编码RNA与基因组调控网络
摘要 在复杂的生物体中,基因的表达水平是通过转录因子和其它调控蛋白综合作用调控的结果,有些调控蛋白甚至能够决定细胞的命运,近来大量的研究也证实了这一观点。但也有研究表明基因组存在着广泛的转录事件,产生...
Strand Specific mRNA sequencing 之重要性与分析
研究生物基因转录体的方法有许多种,而使用次代定序仪系统进行转录体定序是目前相当热门的一种方式,科学家们使用 RNA-seq 分析转录体表现主要期望能够获得三种重要信息: 1. 了解整个转录体构造、sp...
转录组测序问题集锦
转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合,转录组测序(RNA-seq) 是最近发展起来的利用深度测序技术进行转录分析的方法,可以对全转录组进行系统的研究。 Roche GS FLX Ti...
大肠杆菌小RNA与RNA分子伴侣协同作用的新模式
细菌为应对外界环境的变化(紫外辐射,氧化应激,热休克,低温,高渗透压,磷脂糖毒性,铁离子浓度)会产生非编码的小RNA。这些小RNA可以调节mRNA的翻译,或影响mRNA的稳定性。这种对外界环境变化的响...
遗传信息载体—DNA
生物可以繁殖,能够复制出新的一代,通过繁殖后代使物种得以遗传和延续。生物的复制由基因所决定,复制是生命的基本特征,但不是生命的全部特征。计算机程序可以自动复制大量的拷贝,但是这些程序不是活动的生命,活...
microRNA相关的数据库与预测、功能分析软件
miRBase: http://www.mirbase.org miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公...
大米的逆袭:植物操纵了我们的身体吗?
科学家发现,植物中的一些微小RNA会进入人体,控制人体的基因活性,以更主动的方式影响人体。这是第一次实验证明,植物的微小RNA竟然是一个超级杀手,可以跨物种执行任务!这也许证明了“一方水土养一方人”,...