Bioinformatics

primer3引物设计详解

关于Primer3的版权: 使用Primer3大致分为两类人:(1)第一类人为直接使用者,使用Primer3,一定程度上要求引用上述文献;(2)程序员,当将Primer3的源代码加入到你的程序中时,要...
阅读全文
Bioinformatics

测序数据分析工具大全

目前有不少用于基因组装配和比对的程序和算法,但是该选哪一个呢?许多序列分析的专家认为,这取决于基因组的大小、读取有多长,以及采用的是哪种测序技术。通常,软件还需要优化,以满足每个实验室的独特需求。在此...
阅读全文
Glossary

序列以及序列比对中常见术语

有些你看着知道,其实让你说,又说不出多少;有些你以为自己知道,但你不知道自己仅仅了解了其中的一部分。许多概念,虽说只是一个词,但是其背后是一个专业的领域模型,每一个概念在不同的环境有着不同的故事,看见...
阅读全文
Bioinformatics

FASTX-Toolkit

FASTX-Toolkit是一款用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序,里面包含了丰富的FASTA/FASTQ文件格式转换、统计等命令。 下面是其功能介绍:  FASTQ-t...
阅读全文
Glossary

454 GS FLX测序原理

454生命科学公司所研发的新一代测序平台基于光纤微流体技术和包裹了待测DNA片段的乳化液滴技术(炸药中的表面活性剂来维持乳液的热稳定性)。基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Se...
阅读全文
Glossary

Fasta格式说明

序列的Fasta格式是最经常看到的格式之一。下面简介说明一下什么是FASTA格式。 Fasta格式开始于一个标识符:">",然后是一行描述,下面是一行行的序列。每一行最好不要超过80个字母。 如...
阅读全文