CSC基因组浏览器在大规模高通量数据的可视化和比较分析研究中发挥着重要的作用。拥有了本地浏览器,就可以对自己的测序数据进行更深入的分析和共享使用。本文详细介绍了如何一步步在本地安装、配置、高级使用UC...
用UCSC提供的Genome Browser工具来可视化customTrack
k7t9hTmRkucustomTrack,我这里翻译为自定义的测序片段示踪文件,可以追踪我们的reads到底比对到了参加基因组的什么区域,或者追踪参考基因组的各个区域的覆盖度,测序深度!翻译自:ht...
利用UCSC找序列的上下游基因
如果有一段序列,想找到其上下游基因,方法很多,发现用UCSC比较直观明了。 以下面这段人源序列为例,首先打开UCSC 的Blat界面,选择基因组为“Human”,版本选择最新的“Fed.2009(GR...
UCSC:基因组相关研究的一个有力工具
UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供...