Genomics

VCF格式详解

CHROM(chromosome):染色体 POS - position:参考基因组variant碱基位置,如果是INDEL(插入缺失),位置是INDEL的第一个碱基位置 ID - identifie...
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Genomics

VCF格式

CHROM 染色体编号 POS 位置 ID 基因ID REF 参考基因组碱基 ALT 样本碱基 QUAL 变异可信度,越高越好 QUAL:Phred格式(Phred_scaled)的质量值,表 示在该...
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Genomics

VCF格式解析

VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文件,下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件,与SAMtools的结果有点不同 VCF文件可以分为两部分看,最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释...
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