这篇文章很长,超过1万字,是本系列中最重要的一篇,因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读,对于有一定经验的老手来说,相信依然可以有所收获。在开始之前,我想先...
从零开始完整学习全基因组测序(WGS)数据分析:第1节 测序技术
前言 基因测序已是时下热门,目前除了华大基因之外,其他分布于全中国的大型测序平台(HiSeq X 10)还有约10个,每个每年大概能完成1.8万人的高深度全基因组测序,加起来就是18万人,如果加上华大...
WGS,WES,RNA-Seq与ChIP-seq之间的异同
全外显子(Whole-exome sequencing)测序是啥?转录组(RNA-seq)测序是啥?ChIP-seq又是啥?它们之间有什么差别么?傻傻分不清,不用怕,多学习下就会了,下面让我们一起来从...
CNVkit分析WGS
CNVkit一般用来分析肿瘤样本的拷贝数变异(使用配对样本或者正常样本建立参考基线的)。实际上,CNVkit也提供了全基因组胚系CNV分析的方法。 一般来说,WGS遗传样本不会做参考样本(也有会用同批...
NCBI在线BLAST可利用的数据库简要说明
Peptide Sequence Databases蛋白序列的数据库 nr All non-redundant GenBank CDS translations + Ref...