实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction，简称为Real-time PCR)，又称定量实时聚合酶链锁反应(Quantitative real time polymerase chain reaction，简称为Q-PCR)。Q-PCR是藉由PCR扩增原理将DNA放大的同时并达到实时定量之结果，若使用传统PCR方法来定量的话是较费时费工又容易污染，因此Q-PCR已经广泛使用在定量这方面。
目前Q-PCR常用化学物质大致上可以分为：非专一性化学物质(SYBR Green )与专一性化学物质(TaqMan probe)。分述如下：
1.SYBR Green I
SYBR Green I是与双股DNA的minor groove结合释放出荧光，因此在PCR过程中可在每一cycle的extension步骤结束时测量荧光的强弱，就可知每PCR cycle中产生了多少PCR product。但要特别注意的一点，SYBR Green I会跟所有的双股DNA结合，所以无法分辨特异性产物与非特异性产物，在这方面来说也是SYBR Green I的缺点。
2. TaqMan probe (hydrolysis probe)
TaqMan probe是一条人工合成oligonucleotid，在oligonucleotid的两端分别标记上不同的荧光物质，5’端荧光称为reporter而3’端荧光称quencher。假如probe在游离状态时，reporter及quencher的交互作用会互相遮蔽对方的荧光以达到不会发光，当DNA复制时probe被hydrolysis后，reporter与quencher会分开来，而quencher就失去可以遮蔽reporter的效果，则使reporter发光被侦测到。同样的，probe是特异性的与Tag的片段结合，因此不会侦测到非特异的产为，在这部分来说是TaqMan probe的优点。
