我们从最简单的开始，假设两种待比较的诊断方法均给出阳性、阴性二分类的结果，其准确性的比较和研究设计有关。
先说两个独立样本设计的情况。比如，我们想比较心电图、冠状动脉CT在冠心病诊断方面的灵敏度和特异度。假设我们对n1个研究对象进行了心电图检查和冠状动脉造影(金标准)，同时对另外n2个研究对象进行了CT检查和冠状动脉造影。
我们知道灵敏度是在“真病人”(金标准判定的病人)中被诊断为阳性的比例，特异度是“非病人”(金标准排除的病人)中被诊断为阴性的比例。所以，我们根据原始的四格表，列出如下的四格表，作独立样本卡方检验即可
除了独立的设计方案，配对设计也是很常见的。选择n个研究对象，均进行心电图检查、CT和冠状动脉造影。
因为是同一批研究对象，所以a1 c1=a2 c2，b1 d1=b2 d2。比较灵敏度时，我们在“真病人”中找到两种诊断方法的结果，比较特异度时则在“非病人”中，采用配对卡方检验即可。
