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研究物种信息
信息释放时间节点，项目的主要概况，研究目的等
如果已经创建Biosample，则填写BioSample编号，否则创建BioSample
(1) 样品名称（sample name）：无特定格式要求。 (2) 物种（organism）：实验物种的拉丁名。 (3) 个体（isolate）：为该实验样品个体取一个名字，无特定格式要求。 (4) 年龄（age）：格式为【数字】 【时间单位】。 (5) 单位（biomaterial_provider）：实验室或PI的名称和地址等信息，无特定格式要求。 (6) 性别（Sex）：请从下拉菜单中选取符合条件的选项，而不要手动填写。 (7) 组织（tissue）：样品来源的组织类型，无特定格式要求。 蓝色字段为至少一个必填项，可参考绿色字段填写方法；黄色字段则为非必填项。注意，除样本名外，需要可以有信息将每个样本区分开，可以通过添加description信息，或者另外增加replication的信息来进行区分（注意，这里信息如果填写不符合规范，上传后会报错，只需根据提示的信息对表格内容进行相应修改后重新上传即可）
BioSample号
选择添加metadata 的方式，是在线填写或者下载表格填写后上传
我们建议您勾选“Upload a file using Excel or text format (tab-delimited)”并点击下图红框内的“Download Excel spreadsheet”超链接下载模板表格文件，以便在本地电脑上慢慢填写表格。
下载的“表格文件”内含三个工作表：Contact info and instructions、SRA_data、Library and Platform Terms。其中**个和第三个工作表是说明文档，实际填写 SRA 元数据的位置再第二个工作表“SRA_data”。完成填写后，回到网页点击“Choose file”按钮上传文件。SRA 官方建议您将第二个工作表另为 txt 格式再上传，然而实际使用中 Excel 格式的文件基本也能被成功读取识别。
(1) 样品名称（sample name）：无特定格式要求，但需与第五步中上传表格使用过的样品名称保持一致。 (2) 文库ID（library ID）：无特定格式要求。 (3) 标题（title）：建议采用 {methodology} of {organism}: {sample info} 这样的格式，例如“RNA-Seq of mus musculus: adult female spleen”。 (4) 文库方法（library_stratagy)：请从下拉菜单中选取。点击标题超链接，您可以查看到各个选项的说明。对于转录组的测序类项目，请选择 RNA-seq。 (5) 文库来源（library_source）: 请从下拉菜单中选取。点击标题超链接，您可以查看到各个选项的说明。对于转录组的测序类项目，请选择 TRANSCRIPTOMIC。 (6) 文库筛选（library_selection）：请从下拉菜单中选取。点击标题超链接，您可以查看到各个选项的说明。 (6)文库端数（library_layout）：请从下拉菜单选取单端测序（single）或双端测序（paired）。 (7)测序平台（platform）：请从下拉菜单中选取。点击标题超链接，您可以查看到各个选项的说明。诺禾致源绝大多数的测序项目，都请选择 ILLUMINA。 (8)测序仪器（instrument_model）：请从下拉菜单中选取。点击标题超链接，您可以查看到各个选项的说明。例如 Illumina NovaSeq 6000。 (9)方法描述（design_description）：无特定格式要求。 (10)文件类型（filetype）：请从下拉菜单中选取。绝大多数的测序项目是提供 fastq 格式文件。 (11)文件名（filename）：此行所描述的文件的名称（含文件后缀名）。如果存在多个文件，例如对于双端测序而言，请您将R1测序文件的文件名填写在“filename”一列（例如“Sample A1_1.fastq.gz”），然后再将R2测序文件的文件名填写在“filename2一列（例如“Sample A1_2fastq.gz”）。 (12)参考基因组（assenbly 或 fasta_file）：此行上传的数据是 bam 格式等与基因组比对后生成的文件，请提供参考基因组的信息。如果是 NCBI 上的公开基因组，请在 assembly 一列填写基因组版本名称；如果使用的是自定义的本地基因组文件，请在 fasta_file 一列填写基因组文件的名称。如果此行数据描述的文件不涉及基因组比对（alignment）操作，这两列都可以留空
二SRA数据上传常见问题
（error:key passphrase）
以上就是本次数据上传指南的主要内容，希望本次的分享可以给大家带来帮助。