广义线性模型（generalized linear model, GLM)是简单最小二乘回归（OLS)的扩展，在OLS的假设中，响应变量是连续数值数据且服从正态分布，而且响应变量期望值与预测变量之间的关系是线性关系。而广义线性模型则放宽其假设，首先响应变量可以是正整数或分类数据，其分布为某指数分布族。其次响应变量期望值的函数（连接函数）与预测变量之间的关系为线性关系。因此在进行GLM建模时，需要指定分布类型和连接函数。
在R中通常使用glm函数构造广义线性模型，其中分布参数包括了binomaial（两项分布）、gaussian（正态分布）、gamma（伽马分布）、poisson(泊松分布)等。和lm函数类似，glm的建模结果可以通过下述的泛型函数进行二次处理，如summary()、coef()、confint()、residuals()、anova()、plot()、predict()
一、Logistic回归
Logistic回归中假设响应变量服从二项分布，参数family设置为binomial，连接函数link设置为logit，我们以AER包中的Affairs数据集作为例子。该数据集是关于婚姻出轨，其中affairs变量表示出轨次数，数据集中还包括结婚时间、教育、宗教等其它变量。由于affairs为正整数，为了进行Logistic回归先要将其转化为二元变量。
[code lang="R"]
data(Affairs, package='AER')
Affairs$ynaffair[Affairs$affairs < 0] <- 1
Affairs$ynaffair[Affairs$affairs < 0] <- 0
Affairs$ynaffair <- factor(Affairs$ynaffair,
levels=c(0,1),
labels=c("No","Yes"))
model.L <- glm(ynaffair ~ age + yearsmarried + religiousness +rating, data=Affairs, family=binomial())
summary(model.L)
[/code]
若样本观测值变异性过大，即出现了过度离散现象，此时仍使用二项分布假设就会影响系数检测的显著性。那么补救的方法是使用准二项分布（quasibinomial）。首先要检测样本是否存在过度离散现象，方法是用残差除以残差自由度，若超过1则意味着过度离散。那么将family参数改为quasibinomial。
其它和Logistic回归相关的函数还包括：robust包中的glmRob函数实施稳健GLM；mlogit包中的mlogit函数对多分类变量进行logistic回归；rms包中的lrm函数对顺序变量进行Logistic回归。
二、Poisson回归
泊松回归假设响应变量服从泊松分布，而连接函数为log函数。仍以前面未转化的Affairs数据集为例。建立模型后通过coef函数来提取模型系数，因为泊松回归中响应变量经过了log函数变换，所以对系数进行指数变换可更好的对结果进行解释。从中观察到，在其它变量不变前提下，结婚时间增长1年，那么出轨次数期望值则变为之前的1.11倍。
[code lang="R"]
model.P <- glm(affairs ~ age + yearsmarried + religiousness +rating, data=Affairs, family=poisson())
exp(coef(model.P))
[/code]
(Intercept) age yearsmarried religiousness rating 15.6175253 0.9733061 1.1163656 0.6971279 0.6691823
同样，在进行泊松分布也要考虑过度离散现象。其检测方法同样是残差除以其自由度。若确定过度离散存在，则要将family参数设置为准泊松分布(quasipoisson)。
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