甲基化测序方法有多种，以上列举了十几种，相信这也使大家经常会用到的种类，其中不知包含了甲基化研究的方法，还包含了羟甲基化的研究方法，当然现有的羟甲基化研究手段还不是很成熟，至少在我接触到的老师当中，很少有研究羟甲基化的，5hmC本身就很少，有文章中指出5hmC知识中间体，是去甲基化的中间产物，其过程为5mC->5hmC->5caC->C,所以个人觉得，羟甲基化对于调控机理的研究很有帮助，其实很多科研一直在寻找生命活动的“开关”甲基化也许就是其中很重要的一个。希望多多关注，也希望有好的科研文章可以分享。
Bisulfite处理后进行全基因组测序
另外对于现有的高通量甲基化研究方法，最好的无疑是Bisulfite处理后进行全基因组测序，但是对于基因组较大的物种，这种方法太奢侈了，费用太高，及时现在测序费用不断降低的前提下也一样让科研工作者很难接受，另外，测序产生的数据也是巨大的，给分析带来的负担也是成倍增加的。
MeDIP-seq和MBD-seq
更有针对性，测序费用不也高，分析数据也相对容易，但是这个方法最大的问题在于，IP下来的东西，MBD下来的东西，是不是你想要的东西，经常会出现结果不可验证，想要的东西得不到，得到的不想要，非常尴尬。
RRBS技术
算是相对较好的，可以确定甲基化位点，减少数据量，通量较高，但是同样，酶切的效率，是这个方法的软肋，有些甲基化的位点并没有被酶切开，导致结果的不全面性，上面提到的5hmC就有可能影响这个酶的没且效果。
捕获测序，甲基化捕获测序
罗氏新推出的方法，技术较新，可以定制，特点在于，只测目标区域，非目标区域不测，另外一点，通过bisulfite处理就可以定向的检测目标区域的甲基化情况，同时能够降低测序的数据量，同样的数据量也可以提高测序深度，其实甲基化测序，30X应该远远不够研究甲基化的水平，所以，这种目标区域甲基化测序的方法，确实是一个好的方法，但是问题在于，这个方法只能发现捕获目标区域内的甲基化，区域外的无法检测，另外，捕获效率也是需要考虑的一个问题，按照外显子捕获的效果估算，能够捕获90%区域，已经是很不错的结果了，所以你想要的结果有可能也会被漏掉。
如果甲基化捕获测序的成本不高，罗氏的这款捕获产品还是很有竞争力的。
原文来自：http://nextseq.com/%E7%94%B2%E5%9F%BA%E5%8C%96%E5%8F%AF%E4%BB%A5%E6%80%8E%E4%B9%88%E7%8E%A9%EF%BC%9F/ 原标题：《甲基化可以怎么玩？》