以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设人类医学数据关联分析精品班。
为了确保教学质量,授课团队由具有8年以上统计学、遗传学、人类医学及计算科学研究经验的老师领衔,曾成功申请、主持或参与国内外多项重大课题,具有丰富的论文写作、发表经验,小班人数限15-20人,1-3天课程可选修,额满为止,预报从速!
主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部
举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼
培训时间:2014年6月25-28日
培训内容及安排:
日期 | 授课题目 | 授课内容 |
第一天 | 概率论和统计学理论基础 | 1、经典概率论及其统计2、贝叶斯概率及其统计 |
R语言统计分析 | 3、R语言基础4、使用R语言进行基础统计学分析 | |
第二天 | 连锁分析和关联分析理论基础 | 5、连锁分析的原理及常用软件6、候选基因关联分析的原理及常用软件 7、全基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件:基于芯片的GWAS,基于NGS的GWAS |
常用连锁、关联软件实习 | 8、MERLIN9、Plink 10、Haploview等 | |
第三天 | 基于NGS的GWAS实用策略 | 11、转录组/外显子组测序原理12、低覆盖度测序+基因型填充原理 13、Linux常用命令 |
基于NGS的GWAS上机 | 14、转录组/外显子组/基因组重测序数据分析15、SNP分型及基因型获得 16、缺失基因型填充 17、NGS-GWAS 18、IGV可视化 19、ANNOVAR功能注释 | |
第四天 | 分子动力学基础 | 20 分子模拟的计算原理21 分子力场的概述 22 分子动力计算的应用 |
常用分子动力学相关软件的使用 | 23 Gromacs24 VMD 25 Pymol |
(课程内容以实际授课为准)
【培训特色】
无需任何计算机语言基础
深入简出,内容精要实用
结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授
统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用
边学边练,重实践,力求实效
小班授课,个别辅导
【报名费用】 注册费:4000元/人,主办方可协助安排入住酒店,住宿费用自理。
【付费方式】 现金、支票、银行转账、银行汇款
单位全称:北京市计算中心 账号:0200151819100023937
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里 备注上:“生物计算事业部——您的姓名”)
【报名优惠政策】
1、2014年6月1日前报名,可享受减免300元优惠。
2、2人团报每人可减免200元,3人以上团体报名每人可减少400元;
3、4+1团报,可免费赠送一个名额
4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。
培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【联系咨询】
张老师 010-59341771,18618295767,邮箱:zhangly@bcc.ac.cn QQ:2814500767
员老师 010-59341773,邮箱:yuanll@bcc.ac.cn
网址:http://bioc.bcc.ac.cn/China/