一：下载安装该软件
软件：NCBI提供的igblastn（linux环境）
需要自己去NCBI的ftp里面下载
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/igblast/release/
要保证igblastn程序文件和以下三个文件夹在同一目录，可以自行下载ncbi的igblast程序，同时要下载这些东西。
其中database根据物种需要自行选择或者自己建库
二：准备数据
输入文件：各个样本经以上步骤处理好的fasta文件
输出文件：得到blast比对结果，一般处理后文件会增大10倍以上
三：运行命令
软件命令：对不同的物种需要不同的库文件，不同的BCR,TCR需要不同的比对策略，好好看说明书
对BCR 对TCR
处理结果如下，每个文件约2.5G大小
我一般是好几个样本一起跑，两百兆的文件需要跑四个小时左右！批处理命令如下，反正一般人也看不懂，就忒给有需求的人！
四：输出文件解读
这个就复杂了，一篇文章根本解释不清楚呀
在我写这篇日志的时候，我后台运行的igblastn程序还在运行，估计明天早上才能跑完
这是我下载的一篇文献里面的数据，可以看到每个fa文件都输出了很大的blast result文件，需要打开一个个解读。
原文来自：http://www.bio-info-trainee.com/352.html